Ci sono molte ipotesi sull'origine dell'uva Pinot. Una discendenza dall'antico vitigno Allobrogica menzionato da Columella (prima metà del I secolo) e Plinio il Vecchio (23-79) non può essere verificata. Non ci sono prove genetiche o botaniche a sostegno dell'ipotesi che sia arrivato in Francia dall'Egitto attraverso la Grecia. Che l'imperatore Carlo Magno (742-814) l'abbia portato sul Reno e l'abbia fatto piantare nel suo palazzo di Ingelheim (Rheinhessen) non può essere provato (ma non è impossibile). Il fatto che il suo pronipote Carlo III, detto il Grasso (839-888), abbia fatto piantare la varietà nell'884 vicino al lago di Costanza nel suo "vigneto reale" non è provato, poiché nessun nome di varietà è menzionato nel documento in questione. E, ultimo ma non meno importante, anche l'origine Italia, che si presume a causa del sinonimo Clevner, è improbabile.
Si presume che la zona tra il lago di Ginevra (Svizzera) e la valle del Rodano (Francia) sia la patria originale dell'uva Pinot. L'ordine dei Cistercensi lo portò nel Medioevo nel Rheingau, da dove si diffuse in tutta Europa. Secondo la variante più probabile, il termine francese "Pinot" deriva dalla forma allungata dell'uva Pinot, che è molto simile alla pigna di un pino (francese "pin"). Le varietà di Pinot, tuttavia, non sono affatto una famiglia, poiché questo associa erroneamente diverse relazioni. Piuttosto, sono il risultato di mutazioni di una varietà originale di Pinot. Allo stesso modo, si contano anche i mutanti cloni, che sono solo discendenti "leggermente" cambiati rispetto ai mutanti. In ogni caso, erano considerati tra le varietà"più nobili" della Franconia nel Medioevo:
